解读Cell | 肠道细菌与HIV的作用，揭示小儿腹泻主要病原体“轮状HIV” 潜在的防治新方法

相比于生物体，人类对于狂犬病染病治疗威慑措施少之又少，对于狂犬病染病类似于于抗击生素的有效治疗方法还从未被发掘出。生物体通常被认为对压抑狂犬病染病从未彼此间。但特定的狂犬病，比如噬菌体可以侵蚀生物体细胞。在各部位被侵蚀的反复里面，如果不孕育出新压制击有助于，在艰难的趋同反复里面无视全然，或不会被自然选择无关，但我们对于生物体是如何压制击狂犬病染病研究局限。轮状狂犬病（Rotavirus，RV）是一种非包膜的双链RNA（dsRNA）狂犬病，仍然是全球范围的主要杂草，每年引发了数十万儿童出新现危及生命的高血压，也是引发了小儿及新生儿高血压的最重要致病。RV 从口进入消化系统，主要染病肠胃水肿，这些细胞存在于一个统被称作小肠细菌大群的大型生态系统里面。小肠细菌大群可防治致病菌。例如，抗击生素处理方式的消化道极易被生物体致病侵殖和患病。这种侵殖阻力被认为体现了特定生物体家族可避免特定类别的致病的潜能。然而，细菌大群对小肠狂犬病染病的影响程度未必很确切。2019年10年初10日，佐治亚州立大学Andrew T. Gewirtz教授团队（一作为石振达指导教授）在Cell杂志上以明达形式刊载了文章Segmented Filamentous Bacteria Prevent and Cure Rotavirus Infection，研究了小肠生物体细菌对轮状狂犬病染病的影响。Rag1-knockout（KO）消化系统内，与患有严重影响狂犬病的人类一样，它们一旦被RV染病，就不会其发展为慢性RV染病。在将Rag1-KO消化系统内用于研究时，我们无意间发掘出了一株对RV染病较强高度压制击力的Rag1-KO消化系统内。我们猜想这些消化系统内获得了特定细菌大群，这赋予了消化道RV的耐药性。我们发掘出它们的RV耐药性与固有淋巴细胞（ILC）无关，也不能够干扰素（IFN），它们对于控制大多数狂犬病至关重要。相反，这些消化系统内对RV耐药性是由单线丝状生物体（segmented filamentous bacteria，SFB）介导的，这种生物体在可避免或治好RV染病的方向上变动了RV和消化道胃，这暗示一种新的有助于，通过这种有助于，小肠细菌大群可以改善健康。事实上，我们发掘出通过对矿物质SFB的小肠细菌大群的重制，拒绝接受重制的消化系统内达致了“百毒不侵”的正常，对多种小肠狂犬病和生物体消除了耐药性。拢 果1. 可散播的细菌必要措施狂犬病和有免疫潜能的消化系统内免受轮状狂犬病染病我们将RV-易感Rag1-KO消化系统内被称作"JAX-RAG"，将上述抗击RV的Rag1-KO消化系统内被称作"GSU-RAG"。将JAX-RAG和GSU-RAG消化系统内放在同一笼子或从GSU-RAG里面重制出新小肠细菌大群，引发了JAX-RAG消化系统内获得RV自认。重制GSU-RAG小肠细菌到制剂（Germ free，GF） Rag1-KO消化系统内里面消除了对RV几乎耐药性，而拒绝接受JAX-RAG细菌大群的GF Rag1-KO消化系统内其发展为慢性RV染病，暗示重制的小肠菌大群可以几乎必要措施消化道，而未必能够消化道本身的菌大群特别强调新杰出新贡献。此外，对较强慢性RV染病的JAX-RAG消化系统内顺利进行GSU-RAG小肠细菌大群（而不是JAX-RAG的）重制，引发了RV抗击原囚禁终止，指出慢性RV染病的治好。哺乳期RAG幼崽与RV的染病引发了水性高血压。RV 引起的高血压几乎被 GSU-RAG 消除，但JAX-RAG 粪不能做到。来得多的是，免疫染色和PCR对胃内RV基因组的定量断定从未RV染病。类似于地，重制GSU-RAG小肠细菌到较强完善免疫系统的野生（WT）消化系统内，使消化道获得了对RV的耐药性。在成年WT消化系统内上，这种必要措施性与重制后RV染病的早晚有关。在重制GSU-RAG小肠细菌后两日内对其顺利进行RV染病，消化道不会被几乎必要措施，不不会被染病；然而7日后顺利进行染病，消化道只不会被部分必要措施。在幼年WT消化系统内（1周和3周）上，顺利进行重制和RV染病，几乎的RV必要措施性不会消除，比如水样高血压几乎不会被几乎消失。2. 探寻必要措施有助于以及起最重要抗击狂犬病的细菌我们尝试了里面和重制确实引发了消化道消除的抗击狂犬病q，比如IL-22，IFN-，但抗击狂犬病抑制作用并未消失。我们还尝试了探寻其他小肠淋巴细胞对这个抗击狂犬病现象的杰出新贡献，通过运用固有淋巴细胞纠正的消化系统内，以及探寻淋巴细胞的数量变化，并且顺利进行重制小肠淋巴细胞，但这些实验都指出，这些免疫q和淋巴细胞对于这个RV耐药性的表现性杰出新贡献局限，因此这种抗击RV 染病的有助于有别于常见抗击狂犬病的有助于。固有淋巴细胞纠正（ILC）的消化系统内，这株消化系统内从未T细胞、B细胞和NK细胞；粒细胞、巨噬细胞和突出新细胞数量都有明显减少。这样在这株消化系统内消化道人体内剩余的淋巴细胞，以及抗击狂犬病的有助于已经很局限了。我们研究了GSU-RAG细菌是否有潜能在胃降低RV染病潜能。拢果令人振奋，从粪里面过滤出新的小肠菌大群可以在从未淋巴细胞的必需下减少RV染病，并且这种抗击狂犬病抑制作用不仅之外RV，但扩展到其他狂犬病，包含VSV，IAV，和reo狂犬病都被不同程度的，在人体内和胃，减少了毒力。对小肠菌大群顺利进行胃混抗击生素处理方式，而不是混抗击真菌处理方式，这种抗击RV的必要措施抑制作用随之消失，确实最重要抗击狂犬病细菌对抗击生素敏感。随后来得具体的抗击生素处理方式指出，最重要抗击狂犬病的细菌对卡那霉素抗性。通过对较强RV抵耐药性的细菌大群加热、过滤和抗击生素的处理方式，然后一定量并重制到无生物体消化系统内，最后顺利进行细菌大群落统计分析。这种方法指出，一株新的单线丝状生物体（SFB）存在于被重制并且消除RV抵耐药性的消化系统内小肠内。这株SFB占被重制消化系统内小肠生物体年均超过95%，并且它足以使消化系统内对RV染病和相关高血压消除耐药性。通过基因测序，RV染病验证，小肠活体染色，重制GSU-RAG混小肠菌大群和这株SFB可以引发相似的消化道表型，包含小肠水肿水肿，小肠表型的变动。这种肠上皮水肿现在被认为和抗击小肠病原细菌染病有密切彼此间。总 拢轮状狂犬病与多种细菌大群共生在小肠水肿，从而锁住细菌影响 RV染病的确实。虽然拔除RV通常能够适应性免疫，但我们无意间发掘出了抗击RV狂犬病的消化系统内，而通常来说拔除狂犬病染病紧紧依赖于免疫系统，而狂犬病的消化道难于拔除狂犬病染病，从而被狂犬病慢性染病，乃至终生被染病。我们假设，这种RV耐药性体现了压制击RV染病的细菌的存在。具体的是，这种RV抵耐药性可通过共宿和粪重制来散播。这种必要措施抑制作用与先前定义的RV增益因素无关，包含固有淋巴细胞ILCs，干扰素、IL-17和IL-22。SFB在胃的定植诱导消化道表型的变化，并减速水肿积压。含有SFB的粪与RV携手幼体，降低了RV胃染病率，揭示了直接里面和RV抑制作用的确实。因此，独立于淋巴细胞，SFB提供必要措施某些小肠狂犬病染病和相关高血压病。许多现代出新处：ZhendaShi1,JunZou1,ZhanZhang1,et al.Segmented Filamentous Bacteria Prevent and Cure Rotavirus Infection.Cell.10 October 2019，